一、定义差异：
卫生监督所主要负责实施卫生监督检查，确保公共卫生法律法规的落实；而卫健委则是一个综合性部门，负责制定和执行卫生政策、管理医疗卫生机构等。
二、职能不同：
卫生监督所侧重于现场检查及执法，如对公共场所、学校食堂等进行检查；卫健委则更注重宏观管理和规划，包括疾病预防控制、医疗资源分配等。
在实际操作中，两者既有合作也有独立工作的情形。例如，在一项突发公共卫生事件的处理过程中，卫生监督所可能会负责现场调查和应急处置，而卫健委将提供政策指导和支持。
通过对比可以看出，虽然二者职责有所交叉，但分工明确、各司其职是它们共同的特点。